系统流行病学
概念及意义编辑本段
传统的“黑箱子”流行病学侧重于识别单一的危险因素,难以揭示完整的病因网络,在研究复杂疾病时具有严重局限。近10年来,随着高通量组学技术和医学大数据的不断发展,系统流行病学应运而生。系统流行病学(systems epidemiology)是现代流行病学的新兴分支与重要补充,其在分子、细胞、组织、人群社会行为和生态环境等多水平、多组学上深入研究疾病发生风险的统计学模型,并对未来风险状况进行计算模拟和预警预测。系统流行病学的发展将直接推动“精准预防”(precision prevention)理念的实现。系统流行病学不仅能推动医学基础研究的进展与突破,还有助于指导实际的疾病防控工作,是未来流行病学发展的必然方向。
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应用领域编辑本段
生物样本库(biobank)是发展系统流行病学的重要支撑。欧美发达国家已将构建具有生物样本库的超大规模人群队列(mega cohort)作为科研战略布局,如英国生物样本库(UK Biobank)、芬兰生物样本库(Finnish biobanks)、美国精准医学跨组学研究(Trans-Omics for Precision Medicine Program),以及正在募集中、目标为100万人的美国“All of Us”研究计划。我国同样建立了一些分立的生物样本库和大型人群队列,如中国慢性病前瞻性研究(China Kadoorie Biobank,CKB),泰州人群健康跟踪调查(Taizhou Longitudinal Study,TZL)以及正在建设之中的精准医学7个区域队列。此外,基于双生子、母婴、家系、患者等特殊人群的生物样本库也逐渐涌现。这将为未来开展全组学设计的复杂疾病的病因研究创造条件。 公卫人
与此同时,在传染病流行病学领域,国外有学者呼吁将系统流行病学的理念引入到肺结核的研究以及血吸虫病和其他热带疾病的防控实践中来。此外,通过整合病原体基因组、宿主基因组以及宿主感染后的转录情况等多组学信息,研究者有望迅速识别病原体,而不需要完全套用传统的“科赫法则”,这一突破将在未来的生物安全与新发传染病防控中发挥重大作用。
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瓶颈障碍编辑本段
首先,在大规模人群中应用多组学检测依赖于成熟的高通量组学技术,即对样本和检测条件的要求不高,检测成本相对低廉、快速且结果稳定。然而,目前除基因组检测外,其他组学的检测技术仍有待进一步发展改善。其次,发展和维持具有生物样本库的大型人群队列往往需要巨大的研究成本,同时,其数据的共享也是面临的难题。再次,整合多组学数据的分析方法也有待进一步探索。
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