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随机扩增多态性DNA

RAPD标记(Random amplifiedpolymorphim DNA , RAPD)是由美国人Williams和Welsh等于1990年利用PCR技术发展起来的一种DNA多态性标记。它是利用随机引物对目的基因组DNA进行PCR扩增,产物经电泳分离后显色,分析扩增产物DNA片段的多态性,此即反应了基因组相应片段由于碱基发生缺失、插入、突变、重排等所引发的DNA多态性。
随机扩增多态 DNA (randomly amplified polymorphic DNA, RAPD),是美国学者Williams和Welsh于1990年首先提出的该技术是通过分析DNA的PCR产物的多态性来推测生物体内基因排布与外在性状表现的规律的技术。RAPD技术是以8-lObp的随机寡核苷酸片段作为引物,对基因组进行PCR扩增,扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳或PAGE电泳检测,研究DNA的多态性。由于随机引fel在较低的复性温下能与基因组DM非特异性的结合,当相邻两个引物间的DNA小于2 000bp时,就能够得到扩增产物。与RFLP相比,RAPD具有很多优点。(1)不需要了解研究对象基因组的任何序列,只需很少纯度不高的模板,就可以检测出大量的信息。(2)无需专门设计RAW)反应引物,随机设计长度为8-10个碱基的核苷酸序列就可应用。(3)操作简便,不涉及分子杂交、放射自显影等技术。(4)需要很少的DNA样本。(5)不受环境、发育、数量性状遗传等的影响,能够客观地提示供试材料之间DNA的差异。可以检测出RFLP标记不能检测的重复顺序区。当然RAPD技术有一定的局限性,它呈显性遗传标记(极少数共显性),不能有效区分杂合子和纯合子。易受反应条件的影响,某些情况下,重复性较差,可靠性较低,对反应的微小变化十分敏感。如聚合酶的来源,DNA不同提取方法,Mg2+离子浓度等都需要严格控制_。
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